Có rất nhiều biện pháp phòng chống dịch bệnh mùa mưa lũ, trong số đó phải kể đến các biện pháp như: Nước rút đến đâu làm vệ sinh đến đấy; thau rửa bể nước, giếng nước, dụng cụ chứa nước; thường xuyên rửa tay với xà phòng; vệ sinh cá nhân hàng ngày, rửa chân sạch và lau khô kẽ ngón chân; tiêu diệt loăng quăng/bọ gậy, diệt muỗi…

Mưa bão làm gia tăng các khu vực chứa nước (vũng nước đọng, rãnh nước chảy xiết, hố ga bị ngập...), từ đó làm tăng nguy cơ tai nạn đuối nước ở trẻ em. Việc áp dụng đồng bộ các biện pháp an toàn là yêu cầu bắt buộc để bảo vệ trẻ.

Trong và sau bão, mưa lũ, ngập lụt sẽ có rất nhiều vi sinh vật, bụi, rác, chất thải… theo dòng nước tràn ra nhiều nơi, gây ô nhiễm môi trường và tiềm ẩn nhiều nguy cơ dịch bệnh. Hơn nữa, mưa lũ và ngập lụt là điều kiện thuận lợi để các loại vi khuẩn, vi rút và trung gian truyền bệnh sinh sôi phát triển và gây bệnh cho con người. Những dịch bệnh thường hay gặp trong mùa lụt bão, mưa lũ